Animal Disease Prevention and Green Development Key Laboratory of Sichuan Province
Animal-derived Bacterial Resistance Database
本平台所有数据的基石,均源自我们设计严谨的现场实验。研究团队深入中国具有代表性的规模化生猪与家禽养殖场,系统采集了包括动物肠道内容物、粪便、养殖环境、饲料及用水在内的关键样本。这种直接从源头获取样本的方式,确保了数据库中每一株菌株都承载着真实养殖生态下的耐药性印记,为您呈现最接地气的耐药性流行图景。
数据库涵盖了全球范围内最具临床和公共卫生重要性的耐药细菌,数据持续更新。主要类别包括:
革兰氏阳性菌:如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、耐万古霉素肠球菌(VRE)、耐青霉素肺炎链球菌(PRSP)等。
革兰氏阴性菌:
肠杆菌目:如耐碳青霉烯类肠杆菌(CRE),包括肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌等。
非发酵菌:如耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)、耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(CRPA)、嗜麦芽窄食单胞菌等。
其他关键病原体:如艰难梭菌、淋病奈瑟菌、结核分枝杆菌等。
单一的耐药表型或基因检测已不足以应对复杂的耐药机制研究。因此,我们对每一株关键分离菌株进行了深度的多组学测序与分析,构建了业界鲜有的三维数据体系:
1. 全基因组:我们完成了高质量的全基因组测序,不仅精确鉴定菌种,更全面注释其携带的耐药基因、毒力因子、可移动遗传元件等。这张“遗传地图”揭示了菌株固有的耐药潜力和水平转移风险。
2. 转录组:通过转录组测序,我们捕捉了菌株在特定压力条件下的基因表达全景。这帮助理解耐药基因何时被激活、调控通路如何响应,从而将静态的基因序列转化为动态的“战斗响应”日志。
3. 蛋白质组:蛋白质是生命功能的最终执行者。我们的蛋白组学数据直接鉴定和定量了功能蛋白的表达水平,尤其是与耐药相关的酶、外排泵等,从功能层面实证了耐药表型的分子基础,完成了从“基因”到“功能”的验证闭环。
我们致力于与全球用户保持沟通,欢迎数据合作、技术咨询或反馈建议。
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